月经颜色发黑、腰痛、肚子痛，可能是由于子宫内膜炎、宫颈炎、盆腔炎等疾病导致。建议患者及时就医，完善相关检查，明确诊断后在医生的指导下进行针对性治疗。
1、子宫内膜炎：多是由于细菌上行感染引起，由于炎症刺激子宫内膜，可出现充血、水肿等症状，从而导致月经颜色发黑，并伴有腰痛、肚子痛的症状。此时可在医生指导下服用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗；
2、宫颈炎：多是由于病原体感染宫颈所致，由于炎症刺激宫颈黏膜，可出现充血、水肿等症状，从而导致月经颜色发黑，并伴有腰痛、肚子痛的症状。此时可在医生指导下服用头孢克肟胶囊、阿奇霉素片等药物进行治疗；
3、盆腔炎：多是由于不注意个人卫生或机体免疫力低下等原因引起，由于炎症刺激盆腔组织，可出现充血、水肿等症状，从而导致月经颜色发黑，并伴有腰痛、肚子痛的症状。此时可在医生指导下服用甲硝唑片、妇科千金片等药物进行治疗；
4、其他情况：如果存在子宫肌瘤的情况，在月经期间可能会对局部造成压迫，从而出现月经颜色发黑，并伴有腰痛、肚子痛的症状。此时可在医生指导下服用米非司酮片、氨甲环酸片等药物进行治疗。
建议患者平时注意个人卫生，勤换洗内裤，并经过暴晒处理。饮食上应以清淡为主，避免食用辛辣刺激性食物，如辣椒等。
