三个月宝宝夜惊，可能是由于白天睡眠时间过长、缺乏维生素D或钙元素等非病理因素引起的。但也有可能是受到惊吓、消化不良等病理性因素导致的。
一、非病理因素
1.白天睡眠时间过长：如果宝宝在白天睡觉的时间比较长，就会出现晚上不睡觉的情况发生，在这种情况下，家长可以适当减少宝宝白天的睡眠时间，来缓解宝宝的症状。
2.缺乏维生素D或钙元素：如果宝宝体内缺乏维生素D或者钙元素时，也会引起上述症状的发生。建议家长平时多带宝宝到户外晒太阳，并且可以在医生指导下给宝宝服用葡萄糖酸锌口服溶液、碳酸钙颗粒等药物进行治疗。
二、病理性因素
1.受到惊吓：如果宝宝受到了外界环境的刺激或者是看了一些恐怖片等，都会使大脑皮层处于兴奋的状态，从而出现上述情况。一般不需要特殊处理，父母可以通过安抚的方式进行改善。
2.消化不良：如果宝宝喂养不当，容易造成积食，进而影响正常的生长发育，会出现腹胀、食欲下降等症状，长期以往会造成营养不良，因此会导致宝宝出现以上不适现象。建议调整饮食结构，以清淡易消化的食物为主，比如小米粥、南瓜粥等，必要时遵医嘱使用醒脾养儿颗粒、健胃消食口服液等药物治疗。
除此之外，还可能与肠道寄生虫感染有关，应及时就诊，明确病因后对症治疗。
