精子活动率低但是畸形可能是由于精索静脉曲张、生殖系统感染、睾丸炎等原因导致的，建议患者及时就医，明确病因后进行针对性治疗。
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张是指精索内蔓状静脉丛异常扩张、伸长和迂曲，可导致阴囊肿大、疼痛等症状。如果患者存在精索静脉曲张的情况，则可能会导致局部血液循环不畅，从而影响到精子的质量，出现精子活动率低但是畸形的情况。此时患者可以在医生指导下服用七叶皂苷钠片、地奥司明片等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过手术的方式进行治疗。
2.生殖系统感染：如果男性存在生殖系统感染的情况，则可能会导致局部组织受到炎症刺激，在炎症因子的作用下，也会影响到精子的质量，出现精子活动率低但是畸形的情况。此时患者可以在医生指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用盐酸左氧氟沙星胶囊、诺氟沙星胶囊等药物进行辅助治疗。
3.睾丸炎：睾丸炎是指由细菌或病毒感染引起的睾丸炎症性疾病，主要表现为睾丸肿胀、疼痛等症状。如果患者存在睾丸炎的情况，则可能会导致局部组织受到损伤，在炎症因子的作用下也会影响到精子的质量，出现上述情况。此时患者可以遵医嘱服用头孢氨苄胶囊、头孢拉定胶囊等药物进行抗感染治疗。必要时，患者也可以通过手术切开引流的方式进行治疗。
除此之外，该现象还可能与附睾炎、前列腺炎等疾病有关，建议患者及时就医治疗。
