没有明确研究和数据表明金针菇会在肠道里待几天，多数需要1~3天才能随粪便排出体外。
金针菇含有丰富的膳食纤维、蛋白质、氨基酸、维生素以及矿物质等营养成分，能够补充身体所需的营养物质。但其所含的膳食纤维属于不溶性膳食纤维的一种，消化道对其起不到消化和分解的作用，所以金针菇在随着粪便排出时，能保持较为完整的形态，但其所含的营养物质基本已经被身体吸收了。
每个人每天进食的食物类型不同、身体消化功能强弱不同，所以金针菇从进入体内到变成粪便的时间也不相同。绝大部分情况下，其在1~3天就可能随着粪便排出体外。如果自身存在功能性便秘、消化不良等问题，金针菇排出的时间可能会更长，无法一概而论。
,金针菇具有促进消化液分泌、提高肠胃蠕动能力、促进排便的作用，因此建议日常生活中适量摄入金针菇。为避免其所含的营养物质流失，可选择焯烫后凉拌、清炒食用。注意一次不能摄入过多，可能会增加消化负担，有导致功能性消化不良的可能性，适量食用即可。
