巧克力囊肿又称为子宫内膜异位囊肿，如果发生破裂，则需要进行手术治疗。但是否一定要切除卵巢，还需要根据患者的年龄、生育要求等情况综合判断。
一、必须要切除的情况
1.年轻女性：对于年轻的女性患者而言，由于此时还具有正常的生育能力，并且卵巢功能也较好，所以一般建议将巧克力囊肿剥除后，再保留其正常卵巢组织，以维持患者的生理功能和生殖功能。
2.深部巧克力囊肿：对于深在的巧克力囊肿，若仅采取单纯的巧克力囊肿剔除术，术后复发率较高，因此通常也需要行全子宫及双侧附件切除术，以免出现复发情况。
二、不一定要切除的情况
1.围绝经期女性：对于接近绝经期的女性患者而言，即45-55岁之间，卵巢功能开始下降甚至衰退，这时即使进行了巧克力囊肿剔除术，也不一定还会再次生长出新的囊肿，故可以考虑只做单纯性的巧克力囊肿剔除术，而无需切除卵巢。
2.有生育需求的女性：对于存在生育需求的女性患者而言，在进行巧克力囊肿剔除术时，也可以选择输卵管通液加病灶清除术，通过此方法既可疏通输卵管，也可达到去除囊肿的目的，从而避免因巧克力囊肿影响怀孕或不孕的情况。
3.其他情况：部分女性患者虽然已经完成生育任务，但是担心长期存在巧克力囊肿会影响身体健康，或者担心腹腔镜手术对身体的影响等，也可能选择进行巧克力囊肿剔除术，不必非得要切除卵巢。
如果巧克力囊肿较小，也没有明显的临床症状，如痛经等，此时可以暂时观察不予处理，定期复查即可。而对于较大的巧克力囊肿，则应尽早进行手术治疗，以免导致病情加重。
