月经推迟头两天发黑量少，有可能是意外怀孕，也可能是内分泌失调引起，并且不排除卵巢功能失调、多囊卵巢综合征的可能性。
1、意外怀孕：如果在同房的过程中没有避孕，受精卵在子宫腔着床，会出现意外怀孕。刚怀孕的时候，由于受精卵着床，对子宫内膜造成一定的刺激，可能会出现月经推迟、阴道少量出血的症状，可自觉月经推迟头两天发黑量少。这种情况下应该充分休息，合理地安排性生活，以后应该按时产检;
2、内分泌失调：平时的精神压力大、经常熬夜、饮食不规律等，都可能会对女性的内分泌水平造成影响，严重的情况下会造成月经推迟、量少、颜色发黑等改变。应尽快进行调理，比如遵医嘱口服黄体酮胶囊帮助催经，坚持用药几天一般就可以见效;
3、卵巢功能失调：持续性熬夜、饮食不规律等，都可能会影响女性卵巢的分泌功能，导致卵巢功能失调。一旦卵巢的分泌功能紊乱后，就可能会出现月经推迟、月经量少、颜色发黑等改变。应该尽快做内分泌检查，判断女性的卵巢功能是否正常。针对雌激素低的女性，建议遵医嘱按疗程吃雌二醇片等药物进行调理;
4、多囊卵巢综合征：内分泌水平对女性的经期影响较大，内分泌紊乱容易引起多囊卵巢综合征，从而会出现月经推迟、量少、颜色发黑等改变，严重情况下还会出现闭经。患有多囊卵巢综合征的女性，可以遵医嘱按疗程吃短效避孕药进行调理，如炔雌醇环丙孕酮片等。
