孕早期要注意预防先天性畸形。经统计，先天性畸形的25%是由于遗传因素引起，如近亲结婚、家族中遗传病等都可能使小儿畸形。2%-3%由孕期服药引起的，6%由于环境因素引起，如病毒感染、酗酒、x线照射、工业废气、废渣，以及农作物中的农药等，65%-70%原因不明。
对孕妇生过先天性畸形儿，家庭有遗传性疾病史，35岁上的高年初产妇，有过死胎，多次流产等，孕早期患过病毒感染而用过化疗治疗，接受过放射线等需要在产前遗传咨询门诊作进一步检查。在怀孕初3个月里，药物对胎儿生长发育影响最为明显，所以一旦确诊怀孕不要滥用药物，如确因病情需要，也要在医生的指导下合理用药。
怀孕3个月内应到产科登记，医生对孕妇进行病史询问，测血压，查尿蛋白及血色素，测体重、身高，测量骨盆，进行全身检查以及妇科检查等，以早期发现疾病进行早期防治，并决定怀胎是否可以继续。
孕早期因胎盘尚未形成而容易流产，故应避免性交和繁重工作。
