喝蜂蜜水并无绝对禁忌，但需注意糖尿病患者慎用、一岁以下婴儿禁食、胃酸过多者空腹少饮、避免高温冲泡及不宜与豆腐同食等情况。
蜂蜜中含有大量的葡萄糖和果糖，进入人体后会迅速被吸收利用，导致血糖水平快速升高。对于患有糖尿病或血糖调节功能受损的人群而言，过量饮用蜂蜜水可能导致血糖波动，不利于病情控制。这类人群若需食用，必须在医生指导下严格限制摄入量，并密切监测血糖变化，切勿自行随意饮用，以免引发高血糖并发症或加重胰岛负担。
一周岁以下的婴儿肠道菌群尚未发育完全，免疫系统较为脆弱。蜂蜜中可能含有肉毒杆菌孢子，成人食用通常无害，但婴儿摄入后，孢子可能在肠道内繁殖并产生毒素，导致婴儿肉毒中毒，出现便秘、吮吸无力、哭声微弱甚至呼吸困难等严重症状。因此，绝对禁止给一岁以下婴儿喂食蜂蜜或蜂蜜水，家长在制作辅食时应严格排查成分，确保婴幼儿饮食安全。
蜂蜜具有一定的酸性，且能促进胃酸分泌。对于本身患有胃溃疡、十二指肠溃疡或胃酸过多症的人群，空腹大量饮用蜂蜜水可能会刺激胃黏膜，加剧胃酸对溃疡面的侵蚀，从而引起胃痛、反酸、烧心等不适症状。建议此类人群避免在空腹状态下饮用，可选择在饭后适量饮用，以减少对胃肠道的直接刺激，同时注意观察身体反应，如有不适立即停止。
蜂蜜中含有丰富的活性酶、维生素及矿物质等营养成分，这些物质对温度较为敏感。若使用超过六十摄氏度的热水冲泡蜂蜜，高温会破坏其中的活性酶结构，导致营养价值大幅降低，同时可能使蜂蜜口感变酸，影响风味。建议使用四十至五十摄氏度的温开水进行冲泡，既能保证蜂蜜完全溶解，又能最大程度保留其天然营养成分，发挥润燥通便的功效。
传统饮食观点认为蜂蜜不宜与豆腐同食，因豆腐中含有多种矿物质及植物蛋白，与蜂蜜中的有机酸混合后，可能产生不利于人体吸收的沉淀物，长期大量同食或许会影响消化功能或导致腹泻。虽然现代医学对此争议较大，但为稳妥起见，建议避免将蜂蜜与豆腐、韭菜等食物同时大量食用。此外，服用某些药物时也应间隔时间再喝蜂蜜水，以免干扰药效吸收。
日常饮用蜂蜜水应注意适量原则，不可将其作为治疗疾病的手段替代正规医疗。建议每日摄入量控制在合理范围内，避免长期过量饮用导致热量堆积引发肥胖。饮用时宜选用温水冲泡，保持清淡口味。若出现腹痛、腹泻或过敏反应，应立即停止食用并及时就医。同时，保持均衡饮食结构，多摄入蔬菜水果，配合适度运动，才能更好地维护身体健康，提升机体免疫力。
