精子成活率高但是有畸形，可能是由于不良生活习惯、生殖系统感染、精索静脉曲张等因素导致的。建议患者及时就医，在医生指导下进行针对性治疗。
1.不良生活习惯：如果男性长期吸烟、酗酒，可能会导致精子质量下降，从而出现精子成活率高的情况。同时，如果男性经常熬夜、过度劳累，也会对精子造成一定的影响，从而出现精子畸形的情况。建议男性戒烟戒酒，保证充足的睡眠时间，避免熬夜。
2.生殖系统感染：如果男性存在生殖系统感染的情况，如睾丸炎、附睾炎等，可能会导致局部组织受到炎症刺激，从而出现上述症状。建议男性遵医嘱服用抗生素类药物进行抗感染治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等。
3.精索静脉曲张：精索静脉曲张是指精索蔓状血管丛因各种原因引起回流不畅或静脉瓣功能障碍而引起的阴囊内静脉丛扩张、伸长和迂曲。该疾病会导致阴囊部位血液循环受阻，使睾丸温度升高，从而影响到精子的质量。建议男性在医生指导下服用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗。必要时可去正规医院通过手术的方式进行治疗。
除此之外，还可能与隐睾症、睾丸炎等因素有关。如果患者伴有其他不适症状或症状加重，应及时前往医院就诊治疗。
