子宫肌瘤微创手术可能存在后遗症，但多数较轻微且可控。常见后遗症包括短期出血、感染风险及远期粘连等，严重并发症概率较低。
微创手术创伤小恢复快，术后1-3天内可能出现轻微腹痛或阴道流血，通常无需特殊处理。部分患者会有低热现象，体温多维持在37.5-38℃之间，与机体应激反应相关。术中二氧化碳气腹可能引发肩部放射痛，1-2周内可自行缓解。泌尿系统刺激症状如尿频尿急，多因导管留置导致黏膜损伤，保持会阴清洁可降低感染风险。术后3个月内月经量可能暂时增多，与子宫内膜修复过程有关。
极少数情况下可能发生严重并发症，如术中血管损伤导致大出血需输血治疗。肠管或膀胱损伤概率不足1%，需二次手术修补。远期盆腔粘连可能引起慢性下腹坠胀，腹腔镜电凝止血过度可能影响卵巢功能。子宫肌层缺损者妊娠后有子宫破裂风险，需严格产检。瘢痕子宫患者再次手术时，可能面临粘连分离困难等问题。
术后应避免剧烈运动1个月，禁止盆浴和性生活2个月。出现持续发热、剧烈腹痛或异常分泌物需及时复查。建议每半年进行妇科超声随访，关注肌瘤复发及卵巢功能。备孕前需评估子宫肌层愈合情况，妊娠期加强产前检查。保持均衡饮食，适当补充铁剂预防贫血，避免摄入含雌激素类保健品。
