阴茎包皮上有很多小颗粒可能是珍珠状阴茎丘疹、尖锐湿疣、生殖器疱疹等疾病引起的，需要根据不同的病因进行治疗。
1.珍珠状阴茎丘疹：珍珠状阴茎丘疹是一种发生在男性阴茎冠状沟的皮肤病，可能与局部刺激有关。主要表现为阴茎冠状沟处出现珍珠样丘疹，一般没有明显的自觉症状。如果患者没有不适症状，一般不需要特殊治疗。如果患者出现瘙痒等症状，则可以遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物进行治疗。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，主要通过性接触传播。尖锐湿疣可发生于男性的龟头、尿道口、肛门等部位，表现为单个或多个淡红色小颗粒，质地柔软。患者可以在医生指导下涂抹咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗。对于体积较大的尖锐湿疣，可以通过激光、冷冻等方式进行治疗。
3.生殖器疱疹：生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起的一种慢性、复发性疾病。主要表现为生殖器部位出现水疱、溃疡等，并伴有疼痛感。患者可以在医生指导下服用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。
除此之外，还可能是梅毒、疥疮等原因导致的，建议及时就医治疗。
