精子成活率低怀孕畸形率高可能是由于不良生活习惯、生殖系统感染、精索静脉曲张等原因导致，建议患者及时就医检查，在医生的指导下进行针对性治疗。
1、不良生活习惯：如果患者长期熬夜或抽烟喝酒等，可能会导致身体免疫力下降，从而引起精子成活率低的情况。此时患者需要养成良好的生活习惯，避免熬夜，戒烟戒酒，适当运动锻炼，增强体质。同时还要注意饮食健康，多吃一些富含优质蛋白的食物，比如鸡蛋、牛奶等，补充身体所需要的营养成分。
2、生殖系统感染：如果患者存在生殖系统感染的情况，如前列腺炎、睾丸炎等疾病，会导致精子质量下降，并且还会出现畸形的情况。此时可以在医生的指导下服用抗生素类药物进行抗感染治疗，比如盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等。必要时也可以通过手术的方式进行治疗。
3、精索静脉曲张：如果患者存在精索静脉曲张的情况，也会导致精子成活率低，并且还会出现畸形的情况。此时可以遵医嘱服用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗。必要时也可以通过腹腔镜下精索静脉高位结扎术等方式进行手术治疗。
除此之外，也有可能是附睾炎等原因造成的。如果患者出现不适症状，建议及时去医院就医治疗。
