精子百分九十九畸形，可能是由于精索静脉曲张、生殖系统感染、睾丸发育不良等原因所导致。建议患者及时就医，明确病因后进行针对性治疗。
1、精索静脉曲张：通常是指精索内的静脉迂曲扩张，可能与先天性因素有关，也有可能是后天性因素所致。如果病情比较严重，可能会导致局部血液循环不畅，从而影响到精子的质量，出现精子百分之九十九畸形的情况。此时可以在医生的指导下服用药物进行治疗，比如七叶皂苷钠片、迈之灵片等药物缓解症状；
2、生殖系统感染：如果平时不注意个人卫生工作，或者是存在多个性伴侣，可能会导致生殖系统受到细菌感染，从而引起前列腺炎、附睾炎等疾病。炎症因子持续刺激局部组织，可导致精子质量下降，甚至出现精子百分之九十九畸形的情况。此时可以遵医嘱服用抗生素类药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、头孢克肟分散片等药物缓解症状；
3、睾丸发育不良：若在胚胎时期出现了染色体异常的情况，则会导致睾丸发育不良，在成年后也会出现精子百分之九十九畸形的情况。此时需要通过辅助生殖技术来达到生育的目的。
除此之外，还可能与隐睾症有关。建议患者及时去医院男科就诊，并积极配合医生进行相关检查和治疗。
