阴茎根部有菜花状豆豆，可能是尖锐湿疣、皮脂腺囊肿、毛囊炎、生殖器疱疹等疾病导致。建议患者及时前往医院就诊，完善相关检查后，在医生指导下进行针对性治疗。
1、尖锐湿疣：通常是感染人乳头瘤病毒所引起，会导致局部出现赘生物，如菜花状的豆豆，并伴有异物感和疼痛感。可以遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物治疗，也可以采取激光治疗或液氮冷冻治疗；
2、皮脂腺囊肿：主要是由于皮脂分泌过多堵塞在毛囊口而引起，可能会导致阴茎根部出现菜花状的豆豆，并且会伴有红肿以及疼痛等症状。可以遵医嘱服用阿莫西林胶囊、头孢克肟片等药物治疗，如果症状比较严重，也可以通过手术切除；
3、毛囊炎：通常是细菌感染所致，可表现为以毛囊为中心的红色丘疹，并伴有瘙痒以及疼痛等症状。可以遵医嘱外用夫西地酸乳膏、莫匹罗星软膏等药物治疗；
4、生殖器疱疹：通常是单纯疱疹病毒感染所致，会导致阴茎根部出现水疱，并伴有疼痛以及烧灼感。可以遵医嘱服用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等抗病毒药物治疗。
还可能与梅毒有关。平时要注意保持患处清洁卫生，避免用手抓挠。
