临床上并没有专门针对大肠埃希菌感染的药物，但患者可以在医生指导下使用黄连素片、复方新诺明胶囊等进行抗炎杀菌。
1、黄连素片：为抗菌类非处方药药品。具有清热燥湿，泻火解毒的功效，在临床上主要用于治疗细菌性痢疾和阿米巴痢疾引起的腹痛腹泻症状；
2、复方新诺明胶囊：主要成分是磺胺甲恶唑与甲氧苄啶，是一种复合制剂，可以抑制敏感菌对氨苯砜和其他抗生素产生的耐药性，并且还可以增强其他抗生素的作用效果。该药物适用于治疗由葡萄球菌属（包括金黄色葡萄球菌）或化脓链球菌所致的各种严重感染以及沙眼衣原体导致的泌尿生殖系统疾病如宫颈炎、附睾炎及尿道炎等。
3、盐酸左氧氟沙星分散片：属于喹诺酮类抗菌药物，通过干扰细菌DNA旋转酶活性而阻碍细菌DNA复制从而达到抑菌作用；对于革兰氏阴性和阳性菌均有良好的杀灭作用，可用于治疗各种敏感菌所引起的大肠埃希菌感染性疾病，比如急性单纯性下尿路感染、复杂性皮肤及其附属结构感染、慢性支气管炎急性发作期伴发肺炎、社区获得性肺炎等。
4、头孢克肟颗粒：属于第三代头孢菌素类抗生素，可起到广谱抗菌的效果，能够有效杀死多种致病菌，缓解因上述原因造成的不适感，减轻咳嗽咳痰等症状。少数患儿在用药后可能会出现恶心呕吐、皮疹瘙痒等不良反应，需要立即停止服用本品并咨询医师处理。
5、罗红霉素分散片：用于治疗咽炎、扁桃腺炎、鼻窦炎、上呼吸道感染、急慢性支气管炎等多种炎症性疾病，也可用于治疗伤寒、霍乱、鼠疫、布鲁杆菌病等特殊感染，能促进身体恢复健康状态。
除以上几种外还有银花灵丹丸、三九胃泰颗粒等药物也可以辅助改善病情。如果服药一段时间之后没有得到明显的好转，则建议及时去医院就诊查明病因遵医嘱更换其他的药物或者联合用药来治疗。日常生活中要注意多休息，避免过度劳累，饮食方面也要以清淡易消化的食物为主，多吃新鲜水果蔬菜，少吃辛辣刺激油腻食物。
