阴茎根部黑痣菜花状，可能是由于色素痣、皮脂腺囊肿、尖锐湿疣、黑色素瘤等原因导致。建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。
1、色素痣：如果阴茎根部出现色素痣，可能会出现上述症状，一般不会对身体造成影响，不需要特殊处理。如果觉得影响美观，可以通过激光手术去除；
2、皮脂腺囊肿：如果阴茎根部的皮脂腺导管堵塞，分泌物无法排出，可能会形成潴留性囊肿，从而出现上述症状。如果囊肿较小，可以遵医嘱使用红霉素软膏等药物进行治疗。如果囊肿较大，则需要通过手术切除；
3、尖锐湿疣：多是由于不洁性生活引起人乳头瘤病毒感染所致，会导致局部出现菜花状赘生物，并伴有瘙痒、疼痛等症状。可遵医嘱外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物进行治疗。也可采取物理治疗，如冷冻疗法、激光治疗等；
4、黑色素瘤：可能与遗传因素有关，也有可能是长期受到紫外线照射导致，会使皮肤上出现隆起的结节或者是斑块，并且会伴有瘙痒以及疼痛的症状。可在医生指导下服用醋酸泼尼松片、甲氨蝶呤片等药物进行治疗。也可以通过手术切除的方式进行治疗。
还可能是黑色素细胞痣等原因导致。日常生活中应注意个人卫生，保持阴茎部位清洁干燥。
