推拿科和康复科主要在于理论不同、服务人群不同、服务内容不同、服务环境不同以及服务方式不同。
1、理论不同：推拿科主要是基于传统中医经络腧穴理论，进行徒手治疗，通常是指医者运用双手作用于病患的体表、受伤的部位、不适的所在、特定的腧穴、疼痛的地方，具体运用推、拿、按、摩、揉、捏、点以及拍等形式多样的手法，以期达到疏通经络、推行气血、扶伤止痛、祛邪扶正、调和阴阳的疗效；康复科则是基于现代医学如人体解剖学、神经科学等学科进行治疗。通过运动训练、手法治疗、健康教育与指导帮助因受伤、残疾、疾病造成的人体功能障碍进行最大限度的改善，康复的目标在于患者重返社会、重返家庭。
2、服务人群不同：推拿科是一个运用传统中医推拿手法结合多种物理疗法，以治疗颈肩腰腿痛、常见内科病、妇科病、儿科病为主的临床科室；康复科全称为康复医学科，是以促进残疾人以及患者康复为目的，主要是针对疾病已经治疗好转，处于康复期的患者，或存在功能障碍的患者进行预防、诊断、评估、治疗、训练和处理的医学科室。
3、服务内容不同：推拿科通过推拿可以改善人体的血液循环，舒筋通络，缓解肌肉紧张，对于消肿止痛、缓解疲劳有一定的作用；康复科通过推拿可以提高人体的免疫力，对于辅助治疗疾病有一定的作用。
4、服务环境不同：推拿科的服务环境相对比较嘈杂，如果在服务环境中放置过多的设备，可能会影响到推拿按摩师的正常工作。康复科的服务环境相对比较安静，不会影响到正常的工作。
5、服务方式不同：推拿科主要通过对人体的按摩，从而达到缓解疲劳、放松肌肉的目的。康复科通过针灸、艾灸等理疗方式，可以促进人体气血的运行，从而辅助改善身体的不适症状。
无论是中医推拿按摩师还是中医康复理疗师，在进行推拿按摩时，都需要注意力度，避免过度用力，以免给自身带来不必要的损伤。如果在按摩的过程中出现了不适的症状，应立即告知医生，以免延误病情。
