精子畸形率高，可能会导致不育，怀孕之后容易导致胚胎停育、早产、畸形率增高等。精子畸形症要根据具体病因进行针对性处理，常见的病因有不良生活习惯、感染、环境污染、遗传等。
1、不良生活习惯：比如长期抽烟、喝酒，经常在高温环境下工作，或经常接触化学毒物等，这些都会导致精子畸形率高，建议改变不良的生活习惯，不要经常在高温环境下工作，不要接触化学毒物，同时要戒烟戒酒，合理休息，避免熬夜，可以遵医嘱使用生精胶囊等药物治疗;
2、感染：比如睾丸炎、附睾炎、前列腺炎等，当感染持续加重以后，可能导致精子畸形率增高。确诊为睾丸炎后可遵医嘱使用抗菌药物治疗，如盐酸环丙沙星片、阿奇霉素分散片等。附睾炎可遵医嘱使用抗生素类药物治疗，如注射用头孢曲松钠、头孢呋辛酯片等。前列腺炎可遵医嘱使用前列舒通胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行针对性治疗;
3、环境污染：如果长期处于污染环境当中，比如从事化学实验室相关工作，可能会导致精子畸形率高。在改善环境以后，通常能够自行好转;
4、遗传：例如染色体异常或者是家族遗传因素导致精子畸形率高，这种情况属于较严重的情况，必要时需考虑终止妊娠。
精子畸形症患者建议及时就医治疗，治疗期间禁止性生活，并且要遵医嘱合理用药，避免乱用药物，均衡饮食，多吃营养丰富的食物，有利于疾病恢复。
