男性生殖系统包括睾丸、附睾、输精管等，如果这些器官出现异常情况，则可能会导致不孕。而阴茎本身没有影响生育的功能，并不会引起不孕。
1、先天性发育不良：如隐匿型阴茎或小阴茎，由于阴茎体过短或者包皮口狭窄等原因，在进行同房时无法将龟头完全露出，此时可能会影响精子与卵子结合而导致不孕；
2、炎症感染：若存在前列腺炎、尿道炎等情况，可因细菌侵入泌尿系组织内引发局部充血水肿以及分泌物增多的情况，从而造成逆行感染至男性的睾丸部位，使睾丸功能下降，进而降低受孕概率甚至导致不孕的发生；
3、其他原因：当患有内分泌疾病，比如多囊卵巢综合征、高催乳素血症等，均有可能会导致排卵障碍和黄体功能不足，从而使女性怀孕的概率大大减少。还有可能是染色体异常所引起的无精症或者是少精症等，也会对正常妊娠产生一定的影响。
建议有备孕计划的人群在日常生活中保持良好的生活习惯，避免熬夜，注意饮食均衡营养，适当运动锻炼身体增强体质。同时也要定期到医院体检了解自身健康状况，及时发现并治疗原发性疾病。
