宝宝消化不良一般不会眨眼睛，消化不良主要是由胃肠功能紊乱引起的。一般会表现为上腹部疼痛、腹胀、早饱、嗳气等症状，不会导致宝宝眨眼睛。宝宝眨眼睛可能与视疲劳、结膜炎、倒睫、小儿抽动秽语综合征等因素有关。
1、视疲劳：如果宝宝长期看手机或者电脑，又不注意休息，就会导致眼睛出现干涩的情况，从而出现视疲劳，导致宝宝消化不良，眨眼睛的现象，还可能出现流泪的症状。家长应避免让宝宝长时间看手机或电脑，多让宝宝休息，也可在医生指导下给宝宝滴滋润的眼药水，比如玻璃酸钠滴眼液;
2、结膜炎：如果宝宝用手揉眼睛，就可能导致结膜炎，会出现眼睛发红、干涩、发痒等症状，还会出现异物感，导致宝宝消化不良眨眼睛。可在医生指导下给宝宝滴抗生素类眼药水，比如妥布霉素滴眼液;
3、倒睫：宝宝先天性睑内翻可致倒睫，倒生的睫毛摩擦角膜，会有异物感，出现流泪和眨眼睛的症状，家长可带宝宝前往医院进行睑内翻矫正术治疗;
4、小儿抽动秽语综合征：与遗传因素、神经生理、心理因素和环境因素等诸多方面有关。大多为不自主、无目的、快速的肌肉抽动，也有一些可早期表现为局部诱发性肌肉抽动，眨眼是抽动症常见的首发症状，可导致宝宝消化不良眨眼睛。建议及时前往医院就诊，在医生指导下进行专业性治疗。
平时需要多关注宝宝的身体健康，还需要做好日常护理工作。如果发现有任何不适症状出现，需要及时就医检查治疗。
