宝宝停益生菌就消化不良，可能是益生菌不足、胃肠功能紊乱、肠道菌群失调症、肠道感染等原因引起，建议家长尽早带宝宝就诊，明确具体诊断后再给予针对性治疗。
1、益生菌不足：如果给宝宝补充益生菌的量或者种类不足，可能会导致宝宝胃肠道菌群失调，胃肠蠕动变慢，食物无法及时消化，而出现宝宝停益生菌就消化不良的情况，此时可以在医生指导下增加益生菌，比如布拉氏酵母菌散等，同时也可以按摩宝宝腹部促进胃肠蠕动;
2、胃肠功能紊乱：如果宝宝对益生菌不耐受，可能会引起胃肠功能紊乱，导致宝宝停益生菌就消化不良的情况，此时需要遵医嘱服用助消化药物进行治疗，比如健胃消食片等;
3、肠道菌群失调症：如果宝宝肠道内有害细菌较多，但益生菌较少，可能会导致肠道菌群失调，进而引起停益生菌就消化不良的情况，可遵医嘱给予益生菌进行调理，比如布拉氏酵母菌散等药物，同时也要避免宝宝进食过多;
4、肠道感染：如果在给宝宝补充益生菌的过程中没有注意卫生，可能会引起细菌或病毒感染，导致宝宝停益生菌就消化不良的情况。如果是细菌感染可以遵医嘱给予抗生素类药物治疗，比如头孢克洛颗粒等。如果是病毒感染引起时，需要给予抗病毒药物进行治疗，比如利巴韦林颗粒等。
