精子畸形高活力低，可能存在多种情况，如不良生活习惯、疾病因素等。需要根据导致上述情况的具体原因，采取相应的处理措施。
一、一般治疗：
1、改善不良生活习惯：如吸烟、饮酒、熬夜、饮食不规律，以及长期接触生化物质等，均可能导致精子畸形高活力低。此时建议改变不良生活习惯，如戒烟戒酒，避免熬夜，保持充足的睡眠与休息，还要均衡饮食，适当进行体育锻炼;
2、改善精子质量：可遵医嘱应用生精胶囊、左卡尼汀口服溶液等药物进行治疗，可提高精子质量。同时还要针对精子畸形做相应治疗，如服用头孢地尼片、阿莫西林胶囊等抗感染药物，或者使用枸橼酸氯米芬片等药物进行治疗。
二、手术治疗：
1、精索静脉曲张：可以进行精索静脉结扎术，将一侧的精索静脉高位结扎，对侧的精索静脉需要进行结扎;
2、睾丸炎：可以进行局部抗炎治疗，如使用硫酸镁溶液湿敷，减轻炎症因子对睾丸的刺激，防止影响精子的质量，同时还要保持局部清洁卫生;
3、睾丸肿瘤：通常需要进行手术切除治疗，根据病理结果进行化疗等。
还可以通过中医治疗进行辅助治疗，如服用生精胶囊、五子衍宗丸等药物。日常生活中要饮食清淡，避免熬夜，戒烟戒酒，同时适当增加体育锻炼。
