小便时会阴部有时刺痛可能是尿道炎、前列腺炎、膀胱炎等疾病引起的，建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。
1.尿道炎：尿道炎是由于淋球菌或非淋球菌感染引起的炎症反应，主要表现为尿频、尿急、尿痛等症状。如果患者在排尿时出现上述症状，可能是患有尿道炎。建议患者及时就医，在医生的指导下使用盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗。
2.前列腺炎：前列腺炎是指由多种复杂原因和诱因引起的前列腺疾病，以尿路刺激症状和慢性盆腔疼痛为主要临床表现。如果患者患有前列腺炎，可能会出现上述症状。建议患者及时就医，在医生的指导下使用阿莫西林胶囊、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物进行治疗。
3.膀胱炎：膀胱炎是由细菌感染引起的膀胱壁急性或慢性炎症性疾病，主要表现为尿频、尿急、尿痛等症状。如果患者患有膀胱炎，也可能会出现上述症状。建议患者及时就医，在医生的指导下使用诺氟沙星胶囊、盐酸环丙沙星胶囊等药物进行治疗。
除以上常见原因外，还有其他可能性疾病，如肾结石等。如果患者出现不适症状，建议及时就医治疗。
