宝宝消化不良的药物菌，通常是指益生菌类药物。如果宝宝出现消化不良的情况，建议家长及时带宝宝就医，在医生指导下选择合适的益生菌进行治疗。
1、双歧杆菌三联活菌散：属于一种微生态制剂，主要成分是双歧杆菌、嗜热链球菌、乳酸杆菌等，可以调节肠道菌群失调，促进胃肠道蠕动，缓解消化不良的症状；
2、枯草芽孢杆菌二联活菌颗粒：是一种复方制剂，主要成分是枯草芽孢杆菌、地衣芽孢杆菌等，可以补充人体正常生理细菌，抑制致病菌的生长繁殖，还可以调节肠道菌群失调，从而改善消化不良的症状；
3、酪酸梭菌二联活菌散：是一种微生态制剂，主要成分是酪酸梭菌、婴儿双歧杆菌等，可以补充人体正常生理细菌，抑制致病菌的生长繁殖，还可以调节肠道菌群失调，从而改善消化不良的症状；
4、乳酶生片：是一种助消化药，主要成分是乳酶生和淀粉，可以用于治疗消化不良引起的腹胀、腹痛等症状；
5、健胃消食片：是一种中成药，主要成分有山楂、陈皮、太子参等，具有健胃消食的作用，在临床上主要用于治疗脾胃虚弱所致的食积停滞、不思饮食、嗳腐吞酸等症状。
除此之外，还有乳酸菌素片等药物。在日常生活中要注意合理喂养宝宝，避免一次性喂养过多。同时还要注意让宝宝多休息，并且保持室内空气流通。
