检查精子的畸形率需根据检查方法确定，不同的检查方法，精子畸形率的检查费用也不同，常用的检查方法包括精液常规检查、精子形态分析、染色体检查、尿常规检查等，总体检查费用在几百元到几千元不等。
1、精液常规检查：该检查主要是针对精液中的白细胞、红细胞、精子畸形率、活动度、成活率等进行检查，明确精子质量，整体检查费用在几百元左右;
2、精子形态分析：该检查主要是观察精子的头部、精子的尾部以及精子的细胞形态，整体质量进行判断，精子畸形率的检查费用在1000元左右;
3、染色体检查：主要用于判断是否存在染色体病，需进行抽血检查，所以总体检查费用在3000-5000元;
4、尿常规检查：如果是进行尿常规检查，一般不包括精液常规检查，因此尿常规检查的费用在几百元左右。但如果是进行尿常规检查，同时还需进行尿沉渣检查，总体尿沉渣检查的费用在1000元左右。
上述是一些常见的精子畸形率的检查，还有泌尿系统彩超、男性生殖系统CT检查，以及男性生殖系统核磁检查等，上述检查费用在几千元到几万元不等。建议男性可以去当地正规医院的生殖科就诊，根据个人情况选择合适的检查方法，明确精子畸形率的具体情况。
