珍珠状阴茎丘疹的外观类似细小的圆锥，颜色为白色或淡红色，一般无需特殊治疗；但如果不放心，一定要治疗，那么可以通过物理治疗的方法去除，还可根据自身情况辅以药物治疗或者手术治疗。
物理治疗
1.激光疗法：主要使珍珠疹组织炭化结痂，待痂脱落后，创面为新生的鳞状上皮覆盖。治疗时需在无菌操作和局部麻醉下进行，作用表浅，疗效高，而且不留或仅遗留很轻的瘢痕。但激光治疗费用较高，且容易复发。术后需要定期换药避免感染，直至完全恢复。
2.冷冻疗法：利用制冷剂产生低温使病变组织坏死已达到治疗目的。冻后可见组织发白、肿胀，1～2天内可发生水疱，然后干燥结痂，1～2周脱痂。不良反应有疼痛，继发感染，色素变化。
3.高频电外科疗法：以高频电流的凝固和烧灼作用施行的手术治疗方法。一般对皮肤的作用是将热传导给组织，或通过电流在组织产生热反应，将丘疹去除。但安装有心脏起搏器的患者，特别是安装有Demtal起搏器者慎用，因为高频电流能使起搏器失效。
药物治疗
虽然阴茎珍珠状丘疹对患者健康无危害，可自愈，但如果伴发感染，还应遵医嘱局部涂抹莫匹罗星软膏或氟尿嘧啶软膏，缓解症状，以免并发其它疾病。
手术治疗
若患者包皮过长，为避免包皮垢刺激导致再次诱发珍珠状阴茎丘疹，可行包皮环切术。
阴茎珍珠状丘疹的患者在日常生活中还应每日清洗外阴，特别是性生活前后，更应注意私处清洁干燥，穿宽松内裤，勤换内衣；避免用手搔抓、挤压和摩擦外阴，以免留下疤痕；同时要避免过度手淫和性生活，以免过度刺激导致珍珠状阴茎丘疹加重。
