精子畸形率高的患者能否怀孕，需要根据引起精子畸形率高的原因具体分析，常见引起精子畸形症的原因有生活习惯不良、炎症感染、内分泌异常、免疫系统异常等情况。
1、生活习惯不良：精子畸形率高可能与长期过度抽烟、饮酒，以及熬夜等不良生活习惯有关，此时会导致精子质量下降，可能会出现无法正常与卵子结合的情况，导致怀孕的几率下降，但仍然可以怀孕。建议男性备孕期间戒烟戒酒，保证充足睡眠，同时避免熬夜;
2、炎症感染：如果男性存在前列腺炎、附睾炎或精囊炎等生殖系统炎症时，可能会因射精时精液内蛋白质含量增加，影响精子质量，导致精子畸形率高。建议男性通过药物进行治疗，如头孢拉定胶囊、阿莫西林胶囊等;
3、内分泌异常：男性长期患有高泌乳素血症或甲状腺功能亢进等疾病时，也可能会影响精子质量，导致精子畸形率高，但可以怀孕。此时建议患者前往医院进行血常规、甲状腺功能等检查，根据检查结果进行治疗;
4、免疫系统异常：如果患者存在免疫系统疾病，如类风湿关节炎、系统性红斑狼疮等，可能会导致免疫功能紊乱，产生抗体。精子在体内产生后，可能会受到免疫系统的攻击，导致精子畸形率高。建议患者前往医院明确诊断，在医生指导下使用硫酸羟氯喹片、来氟米特片等药物进行治疗。
出现精子畸形率高的情况时，建议患者及时去医院男科就诊，由医生进行精液常规检查等，明确具体的病情，在医生的指导下进行针对性治疗。
