通常情况下，男性HPV16阳性的患者出现阴茎上有黑褐色小颗粒的情况可能是尖锐湿疣、色素痣等疾病导致。
1.尖锐湿疣：该病是由人乳头瘤病毒感染引起的以肛门生殖器部位增生性损害为主要表现的一种性传播疾病。主要表现为皮肤黏膜赘生物，可发生于任何部位，如男性的龟头、包皮系带处、尿道口及会阴部等。如果患者的症状比较轻，并且没有影响到正常的生活和工作，则不需要特殊治疗，在平时要保持局部清洁卫生即可；但是如果出现了明显的不适感或严重影响到了生活质量时，则需要在医生指导下使用咪喹莫特软膏、鬼臼毒素酊等药物进行缓解，必要时还需要通过激光手术的方式进行改善。
2.色素痣：是一种常见的良性肿瘤，可能与遗传因素有关，也有可能是紫外线照射的原因所造成的。当受到外界刺激后可能会造成上述现象的发生，还会伴有疼痛的症状。此时可以遵医嘱涂抹维A酸乳膏、氢醌霜等药膏来淡化色斑，也可以采取液氮冷冻的方式来去除病变组织，从而达到治愈的目的。
,除此之外，还可能与外伤等因素有关，建议及时就医明确病因并接受规范诊治。日常生活中要注意个人卫生，避免不洁的性生活。饮食方面也要注意合理搭配膳食结构，适当吃新鲜的水果蔬菜以及富含优质蛋白的食物，比如苹果、香蕉、牛奶、鸡蛋等补充身体所需要的营养成分。
