子宫内膜异位症手术风险通常可控，具体风险程度与病情严重性、手术方式及患者个体差异有关。
腹腔镜手术作为常见的微创治疗方式，术中可能发生邻近脏器损伤如肠管或膀胱挫伤，但概率较低，多数情况下可通过精细操作避免。术后可能出现盆腔粘连、感染或出血，其中轻度粘连可通过防粘连材料预防，感染需使用抗生素控制，出血量较少时多能自行吸收。麻醉相关风险如过敏或心肺功能异常，术前评估可显著降低发生概率。
开腹手术因创面较大，术后疼痛、切口愈合不良或深静脉血栓形成风险稍高，但适用于广泛性粘连或病变严重者。极少数情况下可能因病灶侵犯重要血管或神经导致术中大出血，需紧急输血处理，但通过术前影像评估可提前规避。
术后建议患者早期活动预防血栓，遵医嘱使用促性腺激素释放激素类似物如醋酸亮丙瑞林缓释微球预防复发。日常避免劳累及剧烈运动，定期复查盆腔超声，若出现异常腹痛或发热需及时就医。
