精子活力低、畸形，怀孕了是否影响胚胎发育，主要取决于精子活力低、畸形的程度。需及时就医进行具体检查，判断是否影响胚胎发育。
1、精子活力低、畸形程度轻：如果精子活力低、畸形的程度轻，在精液当中没有发现精子，怀孕后胚胎也不会受到影响，可以继续妊娠;
2、精子活力低、畸形严重：当患者精子活力低、畸形严重时，可能会使精子无法正常穿过宫颈、子宫到达输卵管，与卵子结合形成受精卵，但无法正常怀孕，就需要及时就医进行相关治疗。可以遵医嘱使用改善精子活力的药物，如左卡尼汀、硫辛酸等。对于畸形精子症的患者，可以选择五子衍宗丸、复方玄驹胶囊等中成药物提高精子质量。同时，生活上需要注意禁烟限酒、适当锻炼身体、少熬夜、健康饮食等，有助于改善精子的质量，从而提高精子活力;
3、合并其他疾病：少数患者精子活力低、畸形也可能是由于合并生殖系统感染引起，如生殖系统炎症等。可以进一步进行生殖系统彩超、尿常规、前列腺液常规检查等，明确是否合并其他疾病。若同时伴有尿频、尿急、尿痛等泌尿系统症状时，可以同时检查尿常规。如果合并妇科炎症时，建议同时检查白带常规。如果是由于病原微生物感染引起时，建议根据药敏试验结果，使用相应的抗生素进行治疗;
4、其他：如果精子活力低、畸形率高，但仍然可以正常怀孕时，可在医生指导下规律服用叶酸，有助于预防胎儿神经管畸形。
