婴儿3个月出现消化不良、肚子咕咕叫的症状时，可以遵医嘱使用益生菌制剂、健脾消食的中成药物进行治疗。如果症状较重，则需要及时就医，在医生指导下选择合适的药物。
一、非药物治疗
1.益生菌制剂：如枯草杆菌二联活菌颗粒等，此类药物可调节肠道微生态平衡，抑制病原体生长，促进有益菌生长，有助于改善婴儿消化不良的情况；
2.健脾消食的中成药物：如醒脾养儿颗粒、保和丸等，其中醒脾养儿颗粒具有健脾益气、养血安神的功效，可用于缓解婴儿脾气虚引起的不适症状；而保和丸则具有消食导滞的作用，适用于脾胃不和导致的腹胀、腹泻等症状。
二、药物治疗
若婴儿存在消化不良且伴有明显腹痛、呕吐、食欲减退等情况，可以在专业医师指导下服用乳酶生片、复方胰酶散等药物来帮助缓解症状。
三、其他方法
家长也可以给婴儿顺时针按摩腹部，以肚脐为中心，按顺时针方向轻轻按摩5-6分钟，能有效促进胃肠道蠕动，从而缓解上述情况。另外，还可以适当热敷婴儿的腹部，也能起到一定的辅助作用。
日常生活中要注意合理喂养，避免让婴儿吃得过饱或过于频繁，以免加重胃肠负担，不利于病情恢复。平时还要注意做好保暖措施，避免着凉，有利于身体健康。
