大便化验有霉菌是否严重需要根据具体情况判断。如果是由于肠道菌群失调症引起的，并不严重；如果是由真菌性肠炎、慢性胃炎等疾病导致的，则比较严重。
一、不严重的情况
1.肠道菌群失调：若患者长期服用抗生素类药物或存在免疫功能缺陷等情况时，可能会引起肠道菌群失调的现象，进而出现腹泻、腹胀等症状。此时可以在医生指导下使用双歧杆菌三联活菌散、枯草芽孢杆菌胶囊等药物进行治疗。
2.真菌性肠炎：是指由真菌感染所引起的急性肠炎，常见症状包括发热、恶心呕吐以及腹泻等。通常可以遵医嘱口服抗真菌药物进行治疗，例如伊曲康唑分散片、氟康唑胶囊等。
二、严重情况
3.慢性胃炎：是指不同病因引起的慢性胃黏膜炎症病变，临床上主要表现为上腹部不适、食欲减退、反酸嗳气等现象。对于幽门螺杆菌感染者，建议及时就医，在医生指导下采取四联疗法根除幽门螺杆菌，常用药物包括阿莫西林胶囊、克拉霉素胶囊、胶体果铋胶囊和奥美拉唑肠溶胶囊等。
除此之外，还可能是消化不良等原因造成的，因此建议患者到医院完善相关检查并对症治疗。
