精子结构异常是否能自然受孕，通常与引起精子结构异常的原因有关。精子结构异常可由生理因素、疾病因素等原因导致，如果是病理因素导致的精子结构异常，通常不能自然受孕，需要应用药物治疗，改善精子结构。
一、生理因素：
如果男性长期大量饮酒、吸烟，过度食用辛辣、刺激性食物，以及频繁手淫、熬夜等，可能会导致精子质量下降，出现精子结构异常的情况。建议男性调整生活习惯，避免熬夜，戒烟戒酒，合理休息，通常精子结构异常能够自主恢复正常，可正常自然受孕。
二、疾病因素：
1、内分泌疾病：男性患有无睾症、睾丸炎等疾病，导致睾丸生精功能障碍，也会导致精子结构异常，一般不能自然受孕;
2、生殖系统感染：如附睾炎、睾丸炎等，生殖系统受到感染，导致精子的成熟、发育出现异常，也不能自然受孕;
3、先天发育异常：如尿道下裂、隐睾症等先天性疾病，导致精子畸形率增高，质量较差，通常也不能自然受孕;
4、精索静脉曲张：当患有精索静脉曲张疾病时，可导致睾丸局部温度升高，生精小管被破坏，引起精子发生形态学变化，出现异常情况，通常也不能自然受孕。
三、药物因素：
长期服用某些化学药物也会导致精子结构异常，如氯喹、氯苯那敏等，通常停药后就可以恢复生育能力。
放射性因素、化学毒物、空气污染等因素导致的精子结构异常，一般也不能自然受孕。建议男性平时注意个人卫生，规律作息，避免熬夜，戒烟戒酒。适当进行体育锻炼，增强体质，避免疾病的发生。
