阴茎上有两个小红包可能是由于毛囊炎、湿疹、尖锐湿疣等疾病所引起，建议患者及时就医，在医生的指导下进行治疗。
1、毛囊炎：通常是由于不注意个人卫生，导致细菌感染所引起，由于炎症刺激，可出现上述症状。如果局部没有出现破溃的情况，可以遵医嘱涂抹红霉素软膏、夫西地酸乳膏等药物进行治疗。如果出现了破溃的情况，则需要在医生的指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行治疗；
2、湿疹：可能与遗传因素有关，也有可能是免疫功能异常的原因导致，会导致皮肤出现瘙痒、丘疹等症状，并且还会伴有水疱、糜烂的现象。可以在医生的指导下涂抹炉甘石洗剂、糠酸莫米松乳膏等药物进行治疗；
3、尖锐湿疣：通常是由人乳头瘤病毒感染所引起的性传播疾病，具有一定的传染性，会通过性接触传播，患病以后会出现局部有赘生物、疼痛等症状。可以通过激光的方式进行治疗，也可以通过液氮冷冻的方式进行改善。
除此之外，还可能是生殖器疱疹等原因所致。若症状持续加重或伴随其他不适，应及时前往医院男科就诊治疗。
