新生儿三个月包皮过长，若未出现其他不适症状，一般不需要进行特殊处理，随着年龄增大、阴茎发育，包皮过长的情况可逐渐好转。若出现不适症状，则需及时就医，可遵医嘱进行药物治疗、手术治疗等。
1、一般治疗：新生儿三个月包皮过长，若包皮口较松，阴茎可以正常翻出，一般不需要进行特殊治疗。日常注意局部清洁卫生，保证包皮处干燥、干净，避免引起感染即可;
2、药物治疗：新生儿三个月包皮过长，容易导致细菌滋生，从而引起包皮龟头炎，可出现局部红肿、糜烂等症状。可遵医嘱使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药膏进行抗感染治疗，帮助缓解症状;
3、手术治疗：新生儿三个月包皮过长，且出现反复感染的情况下，建议及时到医院就诊，由专业医生进行包皮环切手术治疗。因为新生儿年龄较小，进行手术可能会引起疼痛感，所以需要在全身麻醉下进行手术;
4、其他：新生儿三个月包皮过长，若出现包茎的情况，可能会影响阴茎正常发育，应及时到医院就诊，必要时可在医生的指导下行包皮环切术进行治疗。
家长应注意观察新生儿的生长发育情况，定期带新生儿体检。发现新生儿包皮过长或出现其他不适症状时，建议及时去医院就诊，避免私自用药，以免延误病情。
