治疗霉菌性阴道炎可以采用单纯西药治疗法，也可以用中西医结合治疗。
一般治疗：霉菌性阴道炎外用药积极治疗可以引起霉菌性阴道炎的其他疾病，消除易感因素。保持外阴清洁干燥，避免搔抓。治疗期间禁止性生活。不宜食用辛辣刺激性食品。
改变阴道酸碱度：念珠菌生长最适宜的pH值为5.5，因此采用碱性溶液冲洗外阴、阴道，改变阴道的酸碱度，对霉菌的生长繁殖会有抑制作用。可使用2%～4%的小苏打水冲洗阴道，每日1～2次，2周为1疗程。冲洗后要拭干外阴，保持外阴干燥，以抑制念珠菌的生长。
阴道上药：使用咪唑类栓剂阴道上药，对霉菌性阴道炎有很好的疗效。克霉唑栓每晚1粒，于冲洗后纳入阴道，10～14天为1疗程；或达克宁栓每晚1粒，冲洗后阴道上药，7天为1疗程。
外用药膏：霉菌性阴道炎外用药使用克霉唑软膏或达克宁软膏外涂，可以治疗因霉菌感染引起的外阴炎，减轻外阴痒痛的症状。每日外涂数次，应用2周。益肤清软膏是以益康唑为主药，加有少量局部类固醇治疗剂制成，止痒效果良好，对患霉菌性外阴炎、阴道炎外阴痒痛难耐者更适合。外涂外阴，早晚各1次。
口服用药：由于霉菌感染可以通过性生活在夫妻间相互传染，因此可以通过口服用药对双方进行治疗，口服药同样可以抑制肠道念珠菌。氟康唑口服：一次150毫克，顿服。或斯皮仁诺口服：如为初次感染念珠菌阴道炎，每次服200毫克，于早、晚饭后服用，仅服1天；如为复发性霉菌性阴道炎，斯皮仁诺药量需加大，可每次服200毫克，每日1次，连服3天，也可每日服2次，每次100毫克，连服3天。服药均在饭后。
中草药治疗：使用具有清热解毒，霉菌性阴道炎外用药杀虫止痒作用的中药煎水，熏洗外阴，既可以减轻症状，又能抑制消灭念珠菌。由于熏洗后患者的外阴痒痛、灼热症状明显减轻，因此更适用于急性霉菌性阴道炎的妇女，可以减轻患者痛苦。另外，将中草药制成散剂或栓剂，还可以进行阴道上药。
应用上述方法治疗后，患者的临床症状会很快得到改善，但这并不能肯定霉菌性阴道炎已经痊愈，患者应该坚持完成治疗疗程，然后到医院复查症状，做妇科检查并化验阴道分泌物，如果都无异常，说明近期治愈。以后每月月经干净后还要到医院复查1次上述检查内容，连续3个月，如果都为阴性，才是彻底治愈。
