性功能检查通常需要挂男科或泌尿外科，部分医院可能设有专门的性医学科。性功能障碍可能由心理因素、内分泌异常、血管病变、神经损伤、药物副作用等原因引起。
男科是针对性功能障碍的专业科室，可评估勃起功能障碍、早泄、性欲减退等问题。医生会通过病史采集、体格检查、激素水平检测等方式进行诊断，必要时会建议进行夜间勃起监测或阴茎血流超声检查。常见检查项目包括睾酮水平测定、前列腺特异性抗原检测等。
泌尿外科可处理器质性性功能障碍，如前列腺疾病导致的勃起问题。该科室擅长诊断由泌尿系统病变引起的性功能异常，可能涉及尿流动力学检查、膀胱镜检查等。对于合并排尿异常或生殖器畸形的患者更适合选择此科室。
少数三甲医院设有性医学科，整合心理评估与生理检查。该科室能同时处理心因性和器质性性功能障碍，提供心理咨询、行为疗法等综合干预。适合病因复杂或常规治疗无效的患者，可进行更专业的性功能评估量表测试。
当性功能障碍与激素紊乱相关时需转诊内分泌科。该科室可诊断糖尿病、甲状腺功能异常等内分泌疾病导致的性欲减退，通过血糖监测、甲状腺功能检查等明确病因。尤其适合伴有代谢综合征症状的中老年男性患者。
对于压力、焦虑等心理因素引起的性功能问题，心理科可提供专业评估。通过心理咨询、认知行为治疗等方式改善心因性障碍，必要时会联合男科进行综合治疗。适合突发性功能障碍或伴有明显情绪问题的患者。
进行性功能检查前应避免饮酒和过度疲劳，穿着宽松衣物方便检查。检查当天可携带近期用药记录和既往病历，如实向医生说明症状持续时间和伴随症状。日常保持规律作息和适度运动，避免久坐和过度手淫，均衡饮食有助于维持性功能健康。若检查发现器质性问题应及时治疗，心理因素导致的问题可通过夫妻共同参与治疗改善。
