精子活性低伴有畸形的治疗，主要包括一般治疗、药物治疗和手术治疗等。患者需要根据自身情况，在医生指导下选择合适的治疗方法。
1、一般治疗：如果男性存在不良生活习惯，如长期熬夜、酗酒、吸烟等，可能会导致精子质量下降。建议此类人群及时纠正不良生活习惯，避免熬夜，戒烟戒酒，保持规律作息，适当运动锻炼身体，有助于改善精子质量；
2、药物治疗：如果是由于生殖系统感染引起的精子活性低伴有畸形，则需要遵医嘱使用抗生素类药物进行抗感染治疗，如阿莫西林胶囊、头孢克肟片等。如果是由于精索静脉曲张引起的，则可以遵医嘱服用迈之灵片等药物进行治疗。如果是由于内分泌失调引起的，则可以遵医嘱服用枸橼酸氯米芬胶囊等药物进行调理；
3、手术治疗：如果是由于精索静脉曲张引起的精子活性低伴有畸形，则可以通过显微镜下精索静脉结扎术进行治疗。如果是由于睾丸炎引起的，则可以通过附睾切除术进行治疗。
对于部分严重者，还可以通过辅助生殖技术达到生育目的。
