精子活动率正常畸形率高可能是由于精索静脉曲张、前列腺炎、睾丸炎等原因引起的，需要根据具体病因进行治疗。
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张是指精索蔓状血管丛因各种原因引起回流不畅或静脉瓣膜功能障碍导致的静脉迂曲扩张。患者会出现阴囊坠胀、疼痛等症状，同时还会伴有精子活动率正常畸形率高的现象。患者可以在医生的指导下服用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗。如果病情比较严重，也可以通过显微镜下精索静脉结扎术等方式进行手术治疗。
2.前列腺炎：前列腺炎是由于多种因素引起的炎症反应，比如病原体感染、性生活不规律等。患病以后会导致患者出现尿频、尿急以及排尿困难等症状，随着病情的发展还会导致精子活动率正常畸形率高。患者可以遵医嘱服用盐酸左氧氟沙星胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行治疗。
3.睾丸炎：睾丸炎通常是由于细菌感染引起的，也有可能是因为外伤造成的，患病以后会导致局部皮肤红肿、疼痛等症状，并且还会造成精子活动率正常畸形率高。患者需要遵医嘱服用头孢克肟胶囊、阿奇霉素胶囊等药物进行治疗。
在日常生活中要注意个人卫生，勤换洗内裤，避免发生不洁的性生活。
