1、先天禀赋不足，肾精亏虚，癸水不充。
2、后天失养，心肝肾之气未至。
现代医学认为：本病属胚胎发育异常，即妊娠中、后期雄性激素分泌不足所致。
1、阴茎短小，在勃起状态下长度＜6cm；非勃起状态下长度＜3cm。
2、难以或不能进行正常性生活，或不能完成直立性排尿动作。
3、多伴有男性副性征发育不全，或伴有其他生殖器官畸形。
4、性染色体检查多属正常，其组型是46，XY。
1、缩阳证：指突然发病，阴茎并阴囊上缩，伴有阴茎阴囊剧痛，汗出，心悸者。其不发病时如常人，阴茎及副性征发育均正常。
2、假阴茎短小症：指阴茎在非勃起状态下，虽然长度小于3cm，但在勃起状态下却能显著地延长、增粗2~3倍，且不影响性生活。
4、阴茎阴囊融全：指阴囊皮肤向前扩展呈薄皱壁样达阴茎腹侧，成年后影响性生活者为蹼形阴茎。
4、潜伏阴茎：指阴茎虽貌似短小，但用手向后推压阴茎旁皮肤时，可露出正常大小的阴茎。
5、天宦：阴茎短小，且睾丸及男性第二副性征发育不全，染色体组型为47，XXY等。
