生殖器小红疙瘩，可能是毛囊炎、尖锐湿疣、生殖器疱疹等疾病引起的，需要根据不同的病因进行针对性治疗。
1.毛囊炎：如果患者不注意个人卫生，导致细菌感染，可能会引起毛囊炎。在炎症的刺激下，会导致局部出现红色丘疹，并伴有瘙痒的症状。建议患者遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物进行治疗。同时，患者也可以通过紫外线照射的方式进行辅助治疗。
2.尖锐湿疣：尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒感染引起的性传播疾病，通常会发生在肛门以及外生殖器部位。如果患者的病情比较严重，还会出现疼痛、出血等症状。建议患者遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素软膏等药物进行治疗。必要时，患者也可以通过激光手术等方式进行处理。
3.生殖器疱疹：生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的性传播疾病，主要表现为生殖器部位出现水疱、溃疡等症状。建议患者遵医嘱服用阿昔洛韦片、盐酸伐昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。同时，患者也可以遵医嘱使用炉甘石洗剂等药物缓解皮肤瘙痒的症状。
除此之外，该现象还可能与阴茎珍珠状丘疹病有关。如果患者症状比较严重或持续时间较长，建议及时就医治疗。
