肾囊肿手术后是否影响肾功能，需要根据具体情况进行判断。如果是进行微创手术治疗，一般不会对肾脏造成损伤，也不会影响肾功能。但如果采取的是开放性手术，则可能会对肾脏造成一定的损伤，从而导致肾功能受到影响。
1.不会：如果患者所患的肾囊肿体积较小，并且没有出现明显的不适症状，可以遵医嘱通过穿刺抽吸的方式进行治疗，此时对身体的影响比较小，而且也不容易复发。这种情况下，一般不会对肾脏造成太大的损伤，也不会影响肾功能。
2.会：如果患者的病情比较严重，已经出现了腰痛、血尿等症状，并且在做检查时发现囊肿体积较大，此时则可以通过开放式手术切除病灶的方式进行处理，从而使疾病得到改善。但该治疗方法会对肾脏造成一定的损伤，甚至还会引起肾积水的情况发生，所以会影响肾功能。
建议患者及时就医，在医生指导下选择合适的治疗方式。术后要注意多休息，避免过度劳累，同时也要注意饮食健康，多吃一些优质蛋白的食物以及新鲜的水果和蔬菜，少吃辛辣刺激油腻的食物。
