膀胱结石的发病原因较多，可分为原发性因素和继发性因素。其中原发性因素包括尿路梗阻、感染以及营养不良等；而继发性因素主要与下尿路梗阻有关。
一、原发性因素
1.尿路梗阻：当存在前列腺增生症时，可导致排尿困难，使尿液无法及时排出体外，在膀胱内积聚时间过长，容易形成结晶并逐渐增大，最终发展为膀胱结石；
2.感染：如肾结核，由于患者免疫力低下，会导致肾脏出现结核杆菌感染，如果治疗不彻底或病情迁延，则会引发一系列并发症，比如输尿管狭窄、肾积水等，从而诱发膀胱结石；
3.营养不良：若长期摄入蛋白质不足或者维生素A缺乏，可能会引起膀胱结石的发生。
二、继发性因素
对于一些患有下尿路梗阻疾病的患者而言，比如神经源性膀胱、良性前列腺增生、尿道狭窄等，均可导致尿液在膀胱内停留的时间延长，进而增加晶体析出的概率，因此也易发生膀胱结石。泌尿系统先天畸形也可导致膀胱结石的发生，比如马蹄肾、重复肾盂等。
除上述情况外，还有一些药物也会导致膀胱结石，比如噻嗪类利尿剂，常见有氢氯噻嗪片、呋塞米片等，主要是因为此类药物可以抑制钙质吸收，降低尿液中枸橼酸盐浓度，使得尿液中的磷酸盐、碳酸盐含量增高，从而形成膀胱结石。
