通常情况下，如果在怀孕期间出现胎儿发育异常的情况，则可能会导致宝宝出生后存在先天性畸形。而46天的婴儿检查出直肠阴道瘘可能是由于胚胎染色体异常、母体感染等因素所引起。
描述：1、胚胎染色体异常：当孕妇自身患有某些疾病时，在受精卵形成的过程中就有可能会导致胚胎发生基因突变或缺失等现象，从而造成患儿身体器官组织结构和功能异常的现象，进而引发上述症状的发生。
2、母亲感染因素：若母亲本身有生殖系统炎症性疾病如子宫内膜炎、盆腔炎或者是宫颈炎等情况，并且没有及时进行治疗的话，就会通过胎盘传染给胎儿，使胎儿受到细菌病毒以及支原体衣原体等各种病菌侵入体内，从而使胎儿生长过程中受到影响，最终诱发该情况。
,注意事项：建议家长应带患儿到正规医院完善相关检查明确具体病因后再对症处理。同时还要注意做好日常护理工作，保持局部清洁卫生干燥，避免用手抓挠患处以免加重病情。饮食上尽量以清淡易消化的食物为主，比如小米粥、南瓜粥等等，有助于促进机体恢复。
