接种HPV疫苗后可能出现注射部位红肿疼痛、发热乏力等轻微副作用，极少数可能出现过敏反应或晕厥。HPV疫苗主要用于预防人乳头瘤病毒感染，常见副作用通常会在1-3天内自行缓解。
接种HPV疫苗后较常见的副作用包括注射部位局部反应和全身反应。局部反应主要表现为接种部位红肿硬结疼痛，可能持续1-2天。全身反应包括低热头痛乏力肌肉酸痛等类似感冒症状，体温多在38℃以下，这些反应通常表明机体正在产生免疫应答。部分接种者可能出现胃肠道不适如恶心呕吐食欲下降，这些症状多为一过性。疫苗成分中的佐剂和抗原可能刺激免疫系统产生这些反应，但程度通常较轻。
极少数情况下可能出现严重过敏反应如荨麻疹面部肿胀呼吸困难等速发型过敏反应，这类反应多在接种后30分钟内出现。血管迷走神经性反应如头晕目眩面色苍白出汗等晕厥前表现也可能发生，多与接种时的紧张情绪有关。有报道显示极个别接种者可能出现自主神经功能紊乱如体位性低血压或心动过速。这些严重反应的发生概率极低，接种点通常配备有急救设备和药品以应对突发情况。
接种后应在接种点观察30分钟，出现不适及时告知医务人员。接种后24小时内避免剧烈运动和饮酒，保持接种部位清洁干燥。若出现高热不退或严重过敏反应应及时就医。接种前应如实告知医生过敏史和健康状况，免疫功能低下者需谨慎评估。完成全程接种才能获得最佳保护效果，建议按推荐程序完成所有剂次接种。
