精子畸形率高，通常指的是精子的形态或者精子的畸形率异常，影响精子畸形率的因素较多，精子畸形率高可能会导致受精率下降，引起受孕困难，并且可能会导致流产、胚胎停育、死胎等情况。
1、受精率下降：正常男性的精子畸形率为4%以下，如果畸形率过高，就会导致精子的总体质量下降，在受精后胚胎的质量也会下降，导致胚胎畸形率增加，可能会导致反复流产或胚胎停育;
2、流产：精子的畸形率高，会影响到精子的质量，在与卵子结合形成受精卵后，如果受精卵质量较差，不能正常发育，可能会导致流产。建议存在精子畸形率高的男性，在进行备孕前做详细的检查，必要时及时进行治疗;
3、胚胎停育：正常男性的精子畸形率为4%以下，如果畸形率过高，可能会影响到精子的质量，在与卵子结合形成受精卵后，如果受精卵质量较差，不能正常发育而正常着床，就可能会导致胚胎停育;
4、死胎：如果精子的畸形率比较高，导致精子的总体质量较差，而且还会影响到卵子质量，使得胚胎不能正常发育而形成死胎，通常就需要通过人工流产手术来终止妊娠。
建议精子畸形率高的男性平时不要熬夜、不要吸烟、不要饮酒，应注意适当锻炼身体、清淡饮食、规律作息，同时男性还要避免接触一些放射性物质。
