单纯衣原体感染性病并不多，衣原体感染是由沙眼衣原体感染所致，可引起沙眼，也可以导致泌尿生殖道感染，如非淋菌性尿道炎、淋病等。另外，衣原体感染还可引起性病，如尖锐湿疣。
1、沙眼：由沙眼衣原体感染所致，多因接触患沙眼衣原体感染者的分泌物或被污染物品所致。女性易患外阴阴道炎，宫颈炎和盆腔炎，而男性多引起附睾炎和前列腺炎;
2、泌尿生殖道感染：单纯的泌尿生殖道沙眼衣原体感染比较少见，如果引起尿道炎，一般会表现为尿频、尿急、尿痛，尿道口有脓性分泌物。如果引起膀胱炎，会出现尿频、尿急、尿痛，严重者可以出现血尿;
3、非淋菌性尿道炎：如果引起非淋菌性尿道炎，临床表现一般会出现尿道刺痒、烧灼感，病情严重者可以出现尿道黏膜水肿、渗血，还可能会出现尿道狭窄;
4、淋病：由淋病奈瑟菌感染引起，主要侵犯泌尿生殖系统的黏膜，也可以累及咽喉和直肠等部位。淋病在性病中属于较为常见的疾病，但其发病率近年呈明显上升趋势。初次感染后可表现为尿道炎，如果未经治疗或再次感染则可出现相应受累器官的症状和体征。
衣原体感染临床上根据有无并发症，可分为单纯衣原体感染和沙眼衣原体感染。无论患者是否存在并发症，均建议积极治疗，以免造成传染。治疗以药物治疗为主，多使用抗生素药物，如盐酸多西环素片、盐酸米诺环素胶囊等四环素类药物，以及大环内酯类抗生素，如阿奇霉素片、克拉霉素片等。除此之外，还可进行物理治疗，如液氮冷冻治疗、激光治疗等。
