婴儿出生只有梅毒抗体，这种情况可能是由于母亲患有梅毒导致，也有可能是自身没有感染梅毒，但由于其他原因，如自身免疫系统受损、器官移植等原因，导致婴儿在出生后体内没有梅毒抗体，表现为梅毒抗体阴性，因此婴儿出生只有梅毒抗体这种说法并不正确，建议家长带婴儿到正规医院就诊，进一步明确诊断。
1、母亲患有梅毒：如果母亲患有梅毒，可能会通过胎盘传染给婴儿，导致婴儿出生时只有梅毒抗体，这种情况下婴儿必须进行正规的驱梅治疗，比如肌肉注射苄星青霉素等，以免引起梅毒性脑膜炎、骨髓炎等严重并发症;
2、自身免疫系统受损：婴儿在出生时只有梅毒抗体，可能是由于自身免疫系统受损导致，这种情况常见于母亲患有自身免疫性疾病，比如系统性红斑狼疮、类风湿性关节炎等，导致母体内产生的抗体通过胎盘带给婴儿，所以在出生时只有梅毒抗体，一般不需要进行特殊治疗。如果母亲病情比较严重，则需要使用免疫抑制剂进行治疗;
3、器官移植：如果婴儿在器官移植后发生了排异反应，则可导致体内产生的梅毒抗体滴度会比较高，这种情况下也会在出生时只有梅毒抗体，通常需要及时终止器官移植;
4、其他原因：比如孕期母亲摄入酒精或服用抗生素药物等，可导致婴儿出生时只有梅毒抗体，这种情况下不需要特殊治疗，建议母亲避免饮酒或服用抗生素药物，在医生指导下进行积极处理。
