婴儿HPV感染主要是通过母婴传播感染，另外也可以通过医源性感染、性传播、间接接触传播。HPV主要通过黏膜接触传播，故在进行性生活时也可以传染，也可通过接触衣物、指甲刀、玩具等感染。
1、母婴传播：HPV主要是通过母婴传播，如果母亲存在HPV感染，在分娩过程中通过产道直接接触传播，婴儿可能会在出生后就出现HPV感染。另外在怀孕期间，孕妇体内的HPV会通过胎盘传染给婴儿，且新生儿在出生时也可能会获得HPV，从而出现HPV感染;
2、医源性感染：若婴儿在进行治疗或护理时，因医疗器械没有彻底消毒，或医务人员刚刚接触过HPV感染患者的血液、体液等，且没有及时进行消毒，可能会导致婴儿通过医疗器械间接传染HPV;
3、性传播：如果婴儿通过性生活进行HPV病毒传播，则很可能会导致性伴侣出现HPV感染，在进行性生活时也可传染给性伴侣;
4、间接接触传播：如使用公共坐便器、毛巾或浴巾等，若使用后没有及时进行清洗或消毒，婴儿在使用过程中也可能会导致HPV感染。
由于婴儿抵抗力比较差，很容易出现HPV感染。在怀孕期间可通过母亲血液中的HPV筛查，了解婴儿是否存在HPV感染。若婴儿出现HPV感染，则应尽量选择分娩的方式分娩，避免经阴道分娩。另外建议婴儿注射完疫苗后，也要及时进行相关检查，避免因疫苗抗体未产生导致无法预防疾病的发生。
