喝咖啡一般不会导致精子畸形，咖啡中含有少量的咖啡因，可以兴奋大脑神经，具有一定的提神作用。但长期喝咖啡或者经常大量喝咖啡，可能会影响精子质量，导致精子畸形。精子的产生主要是由睾丸产生的精原细胞，精原细胞在睾丸中产生以后，通过附睾、输精管、精囊，以及尿道射精管的管道到达精囊，在精子生成和成熟的过程中，会受到激素的调控，一般与饮食没有太大关系。影响精子质量的因素包括生殖系统疾病、遗传疾病、药物和化学毒物、全身系统性疾病等。
1、生殖系统疾病：影响精子成熟的生殖系统疾病，主要有睾丸炎、附睾炎、精囊炎、前列腺炎、精索静脉曲张等。长期患有以上疾病，会导致精子成熟障碍，畸形率增加。建议患者及时就诊明确病因，在医生的指导下治疗;
2、遗传疾病：染色体异常导致的疾病，如克氏综合征、性染色体异常等，可能会导致精子的生成和成熟出现问题，表现为少精症或者无精子症;
3、药物和化学毒物：药物和化学毒物对精子的影响，主要是对抗体内的睾丸和卵巢的生殖细胞，影响精子的生成以及引起精子畸形;
4、全身系统性疾病：全身系统性疾病会影响到精子生成以及精子的成熟，如长期的营养不良、吸烟、饮酒、熬夜以及精神高度紧张等。
除以上相对常见原因外，还有其他的可能性疾病，比如严重的糖尿病、高血压等慢性疾病，可能会造成血管硬化等，影响精子的质量。
